molekulárně genetické vyšetření genu pro cystickou fibrózu
Molekulárně genetické vyšetření 34 mutací a 1 polymorfismu CFTR genu metodou CF StripAssay
Princip metody CF StripAssay
Princip stanovení mutací pomocí StripAssay® kitu je založen na PCR (Polymerase Chain Reaction - polymerázová řetězcová reakce) a následné reverzní hybridizaci. Kit kombinuje několik PCR reakcí do dvou multiplexových (několikanásobných) testů. Při multiplex PCR reakci jsou specificky namnoženy sledované úseky genu CFTR. V reakci jsou přítomny pro každou mutaci dva primery. Jeden je specifický pro sekvenci s mutací, druhý pro normální sekvenci. Při hybridizaci analyzujeme, které úseky byly namnoženy, zda jsou přítomny sledované mutace.
Celý proces se skládá ze tří kroků: (1) izolace DNA, (2) PCR amplifikace s biotinylovanými primery, (3) hybridizace amplifikovaných PCR produktů na testovacím stripu (proužku), který obsahuje alelicky specifické oligonukleotidové sondy imobilizované na stripu ve vodorovných proužcích. Navázané biotinylované sekvence jsou poté detekovány pomocí streptavidin- alkalické fosfatázy a barevného substrátu tohoto enzymu.
Kit detekuje 34 mutací a 1 polymorfismus v CFTR genu:
CFTRdel2,3 (21kb), I507del (-ATC), F508del (-CTT), 1717-1G>A, G542X, G551D, R553X, R560T, 2143delT, 2183AA>G, 2184delA, 2184insA, 2789+5G>A, R1162X, 3659delC, 3905insT, W1282X, N1303K [Teststrip A];
G85E, 394delTT, R117H, Y122X, 621+1G>T, 711+1G>T, 1078delT, R334W, R347H, R347P, A455E, 1898+1G>A, 3120+1G>A, 3272-26A>G, Y1092X, 3849+10kbC>T, IVS8 5T/7T/9T [Teststrip B].
Zdroj : www.pentagen.cz
Seznam mutací a polymorfismů na stripu A a B:
O laboratoři
Pro pacienty a samoplátce
- Trochu o genetice
- Co je genetické testování ?
- Jak mám rozumět výsledkům?
- Mám mít z odběru na testování obavy?
- Ceník vyšetření
Pro odbornou veřejnost
Součásti institutu
Adresa laboratoře
FertiCare SE
provozovna Karlovy Vary
Laboratoř lékařské genetiky
Bělehradská 1042/14
36001 Karlovy Vary
Telefony:
Objednání: 353 433 958, 776 202 225
Laboratoř: 353 433 964